1929年7月在上海创刊，季刊，属于医学院刊物。该刊由上海国医学院负责编辑和发行工作，该学院位于上海霞飞路华龙路口。华丰印书铸字所负责该刊的印刷工作。该刊虽然为医学院院刊，但社会其他人士均可订阅。该刊的具体停刊时间和原因不详，馆藏仅有1929年7月至1931年1月出版刊物，共3期。

该刊物的封面简洁，仅有章炳麟题写的刊物名，以及刊物的刊期。该刊的刊物启事中称“本刊内容一洗阴阳五行之说，欲以科学解释中医，不过此种学说在吾国医界中尚是萌芽时代，不妥之处在所不免，倘蒙读者诸君不吝指正惠寄大稿，无任欢迎。”另外，该刊的宗旨在“以科学解释中医”，从而“使中医容纳西医，而成新中医。”。该刊的主要撰稿人有章太炎等。

该刊物内设有目录和固定栏目，主要栏目有评坛、专著、教员论著、讲义一斑、插画、杂俎、学生成绩等。其中“专著”和“教员论著”栏目主要载文涉及药物实验，治疗定律，病理诊断，生理解剖等。如研究前人著作的文章《伤寒论讲词》、《金匮札记》和研究药理知识的文章《柴胡》以及研究病理知识的文章《三焦之考证》、《左肝右肺之真理》等。“杂俎”栏目主要刊载关于中医理论、中药知识、治疗案例等内容的文章。“讲义一斑”主要刊载教学讲义，内容涉及药物学、生物学、细菌学、生理学等方面。“插画”栏目主要学院的合照和院长章太炎的照片。另外，刊末刊载了介绍上海国医学院概况的文章。

《上海国医学院院刊》的创办,在发扬中医文化，增进民族健康，研讨医药问题，改进医药学术有所贡献。另外，对于研究近代以来中国医学教育发展问题以及上海国医学院的相关创设问题提供了一定的参考材料。对于了解民国时期关于中西医差异，以及中医学术发展提供了历史资料。同时，刊内关于中医知识的文章对于中医学科的发展具有一定的参考价值。